行政機關對招標投標活動的監督，是招投標活動監督體系的重要組成部分。依法規范和監督市場行為，維護國家利益、社會公共利益和當事人的合法權益，是市場經濟條件下政府的重要職能。《招標投標法》第七條規定有關行政監督部門依法監督招標投標活動、查處招標投標活動中的違法行為。行政機關對招標投標活動實施監督時，應當遵循職權法定、合理行政、程序正當和高效便民等原則。

行政監督的職責分工。我國招標投標行政監督職責由國務院指導協調部門、招標投標行政監督部門和其他相關部門分別承擔，各行政職能部門根據法律和國務院規定的職責分工，構成一個完整的行政監督體系。根據《招標投標法實施條例》的規定，縣級以上地方人民政府對其所屬部門有關招標投標活動的監督職責分工另有規定的，從其規定。

①指導協調部門。在現行招標投標職責分工下，招標投標行政監督部門很多，必須加強部門之間的協調配合，以保障政令統一，提高行政監督合力。為此，國務院指定國家發展改革委負責指導和協調全國招標投標工作，具體職責包括：會同有關行政主管部門擬定《招標投標法》配套法規、綜合性政策，擬定必須進行招標項目的具體范圍、規模標準并報國務院批準;指定發布招標公告的報刊、信息網絡或其他媒介等。

同時，國家發展改革委作為項目審批部門，負責依法審批、核準應報國家發展改革委審批核準和由其核報國務院審批項目的招標方案(包括招標范圍、招標方式、招標組織形式);組織國家重大建設項目稽查特派員，對國家重大建設項目建設過程中的工程招標投標進行監督檢查。因此，國家發展改革委也是重要的招標投標行政監督部門。

②行政監督部門。國務院工業和信息化、住房城鄉建設、交通運輸、水利、商務等部門，按照規定的職責分工對有關招標投標活動實施監督。按照這一原則，招標投標過程中串通投標、歧視排斥投標等違法違規活動的監督執法，分別由有關行業主管部門負責并受理投標人和其他利害關系人的投訴。例如，各類房屋建筑及其附屬設施的建造和與其配套的線路、管道、設備的安裝項目和市政工程項目的招標投標活動的監督執法，由建設行政主管部門負責;進口機電設備采購項目的招標投標活動的監督執法，由商務行政主管部門負責。根據《政府采購法》的相關規定，各級人民政府財政部門是負責政府采購監督管理的部門，依法履行對政府采購活動的監督管理職責。