被動擴散：以溶質濃度梯度作為動力以使藥物通過細胞膜的一種轉運過程。大多數藥物分子是通過簡單擴散方式透過一層膜被動地從高濃度區(如胃腸液)進入到低濃度區(如血液)。因為藥物分子經由體循環迅速轉運到大容積的體液和組織中去，所以開始時血液中藥物濃度低于給藥部位的濃度，形成大的濃度梯度。擴散速率直接與該梯度成正比，而且還依賴于藥物的脂溶性，解離程度，分子量大小以及吸收表面的面積。由于細胞膜是類脂質，脂溶性高的藥物比脂溶性低的藥物擴散得更快。小分子透過膜的速度也要比大分子快。

　　多數藥物是弱有機酸或弱有機堿，在水性環境中是以非解離型或解離型而存在的。非解離型部分通常是脂溶性的，很容易透過細胞膜擴散。解離型則由于其脂溶性低，不易透過細胞膜，還由于細胞膜表面帶電荷基團也會阻礙解離型通過。因此，藥物穿透速率主要取決于非解離型。一個能解離的藥物透過生物膜到達分布平衡取決于藥物的pKa(藥物的非解離型和解離型濃度相等時的pH)和當時的pH梯度。對于一種弱酸性藥物來講，pH值越高，非解離型對解離型的比率就越低。現設一弱酸性藥物(pKa為4.4)，在血漿中(pH7.4)非解離型對解離型的比率是1：1000，而在胃液中(pH1.4)，則比率相反，為1000：1.當這種弱酸性藥口服給藥時，在胃與血漿之間形成很大的非解離型藥物濃度梯度，這種情況有利于透過胃粘膜擴散。由于只有非解離型藥物能透過細胞膜，故在平衡狀態下，非解離型藥物在胃中和血漿中的濃度相等，而血漿中解離型藥物濃度要比胃中高約1000倍。對于一種pKa4.4的弱堿性藥物來講，其情況則相反。因此在理論上，弱酸性藥物(如阿司匹林)在酸性介質中(胃腔)應當比弱堿性藥物(如奎寧)更易吸收。然而，不管是酸性或堿性藥物，大多數藥物的吸收是在小腸內進行的(見下文口服給藥)。

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