2016臨床執業醫師生物化學第17章蛋白質的合成與運轉復習筆記|臨床執業醫師復習資料
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第一節 概述
一、遺傳密碼
(一)定義:密碼子、遺傳密碼字典
(二)基本特性
1.無標點:是連續閱讀的,若插入或刪除一個堿基,會使以后的讀碼發生錯誤,稱為移碼。
2.一般不重疊:只有少數基因的遺傳密碼是重疊的。
3.簡并性:多數氨基酸有幾個不同的密碼子,只有色氨酸和甲硫氨酸僅一個密碼子。編碼相同氨基酸的密碼子稱為同義密碼子。簡并性可減少有害突變,也使DNA的堿基組成有較大的變化余地,在物種的穩定性上起一定作用。
4.擺動性:密碼子的專一性主要由頭兩位堿基決定,第三位不重要,稱為擺動性。反密碼子上的I可與U、A、C配對,G可與U配對。
5.UAG,UAA,UGA不編碼氨基酸,作為終止密碼子,只能被肽鏈釋放因子識別。AUG是起始密碼子。
6.通用性:在各種生物中幾乎完全通用,但發現線粒體有所不同,如人線粒體中UGA編碼色氨酸。
二、核糖體(環球網校醫學考試網整理2016臨床執業醫師生物化學第17章蛋白質的合成與運轉復習筆記)
(一)結構
1.核糖體RNA:有很多雙螺旋區,16S在識別起始位點中起重要作用。
2.核糖體蛋白:多數為纖維狀,極少數球狀。
3.結構模型:橢圓球狀,兩亞基結合面上有較大空隙,蛋白質的合成在此進行。大亞基上有兩個轉運RNA位點:氨酰基位點(A)和肽酰基位點(P),還有一個水解GTP的位點。兩個亞基的接觸面上有信使RNA結合位點,核糖體上還有許多蛋白因子結合位點。
(二)多核糖體:由一個信使RNA與一些單個核糖體結合而成,呈念珠狀。這樣可以同時合成許多肽鏈,提高了翻譯的效率。6個以上的多核糖體具有穩定的結構。
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第二節 翻譯的過程
一、準備
(一)肽鏈的合成是由氨基端向羧基端進行的,速度很快,大腸桿菌每秒可聚合20個氨基酸。信使RNA是從5’向3’翻譯的(環球網校醫學考試網整理2016臨床執業醫師生物化學第17章蛋白質的合成與運轉復習筆記)。
(二)氨基酸的活化:由氨酰tRNA合成酶催化,分兩步:
1. 形成氨基酸-AMP-酶復合物:氨基酸的羧基與5’磷酸形成高能酸酐鍵而活化。
2.轉移:氨基酸轉移到轉運RNA3’末端,與3’或2’羥基結合。總反應為:
氨基酸+tRNA+ATP=氨酰tRNA+AMP+PPi
此酶專一性很高,只作用于L-氨基酸,每種氨基酸都有一個專一的酶。酶有校對機制,一方面對轉運RNA有專一性,另一方面還有水解位點,可水解錯誤酰化的氨基酸。
(三)轉運RNA的作用:起接頭作用,根據密碼子決定氨基酸的去向。轉運RNA反密碼子的某些突變可抵銷一些有害突變,稱為校正突變。
二、肽鏈合成的起始
(一)起始信號:起始密碼子是AUG,其上游約10個核苷酸處有一段富含嘌呤的序列,可與16S rRNA的3’端互補,與起始有關。
(二)起始復合物的形成:
1.起始氨基酸:是N-甲酰甲硫氨酸,其轉運RNA也有所不同,稱為tRNAf,與甲硫氨酸結合后被甲酰化酶以甲酰四氫葉酸甲基化,生成fMet-tRNAf。
2.30S起始復合物:信使RNA先與小亞基結合,在起始因子3(IF3)的參與下形成mRNA-30S-IF3復合物,然后在IF1和IF2參與下與fMet-tRNAf和GTP結合,并釋放IF3,形成30S起始復合物。
3.30S起始復合物與大亞基結合,水解GTP,釋放IF1和IF2,形成70S起始復合物。此時轉運RNA占據肽酰位點,空著的氨酰位點可接受另一個轉運RNA,為肽鏈延長作好了準備。
三、肽鏈的延伸
(一)轉運RNA進入氨酰位點:需ATP和兩種延伸因子參加。EFTu與GTP結合,再與轉運RNA形成復合物,才能與起始復合物結合。然后釋放出EFTu-GDP,與EFTs和GTP反應,重新生成EFTu-GTP,參加下一輪反應。EFTu水解GTP前后構象不同,錯誤的轉運RNA會離去,而正確的則與兩種狀態都有強相互作用。EFTu-GDP離去之前不能形成肽鍵,它停留的時間越長,錯誤的轉運RNA被排除的幾率越大。這是翻譯的限速步驟。
(二)肽鍵的形成:肽酰基轉移到氨酰位點,同時形成肽鍵。需大亞基上的肽酰轉移酶和鉀離子參加。肽酰位點的轉運RNA成為空的。嘌呤霉素的結構與氨酰tRNA類似,可形成肽酰嘌呤霉素,易脫落,使合成中斷。
(三)移位:指核糖體沿信使RNA移動一個密碼子。原肽酰位點的轉運RNA離開,肽酰tRNA進入肽酰位點。需GTP和延伸因子G(EFG),也叫移位酶。GTP的水解使EFG釋放出來。延伸與移位是兩個分離的獨立過程。
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四、終止
(一)終止信號的識別:
有三種蛋白因子:RF1識別UAA、UAG,RF2識別UAA、UGA。RF3協助肽鏈釋放。
(二)肽鏈釋放:釋放因子使肽酰轉移酶水解并釋放轉運RNA,然后核糖體離開,(環球網校醫學考試網整理2016臨床執業醫師生物化學第17章蛋白質的合成與運轉復習筆記)IF3使核糖體解離,并與小亞基結合,以防重新聚合。
五、真核生物的合成
(一)核糖體:更大,為60S和40S。
(二)起始氨基酸:是甲硫氨酸,但其轉運RNA無TΨC序列。
(三)起始信號:密碼子為AUG,無富含嘌呤的序列。因為是單順反子,只有一個起點,所以小亞基先與帽子結合,向3’端移動尋找即可。
(四)起始復合物:80S,起始因子(eIF)有多種。需GTP和ATP。
(五)延伸因子和終止因子:EF1a相當于EFTu,EF1bg相當于EFTs。終止因子(eRF)稱為信號釋放因子。
(六)蛋白激酶參與調節:可使eIF2磷酸化,抑制下一輪起始,小亞基不能與轉運RNA結合,翻譯受抑制。只有脫磷酸后才能重新起作用。缺乏血紅素時即激活蛋白激酶,抑制血紅蛋白合成。
六、抑制劑
白喉毒素可使移位酶(EF2)ADP-核糖化,抑制真核生物的移位作用。亞胺環己酮只作用于80S核糖體,抑制真核生物的翻譯。氯霉素、鏈霉素、四環素、新霉素、卡那霉素只作用于原核生物,鏈霉素、新霉素、卡那霉素與小亞基結合,引起錯讀。
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第三節 多肽的運輸和加工
一、信號肽
(一)特點:長度為13-26個殘基,氨基端至少有一個堿性殘基,中部有10-15個殘基的疏水肽段,羧基端有信號肽酶酶切位點。一般位于新生肽的氨基端,某些位于多肽的中部。
(二)功能:信號肽合成后被信號識別體(SRP)識別。信號識別體與核糖體結合(環球網校醫學考試網整理2016臨床執業醫師生物化學第17章蛋白質的合成與運轉復習筆記),使肽鏈延伸暫停,將核糖體帶到內質網,形成粗糙內質網。這里合成溶酶體蛋白、分泌蛋白和構成質膜骨架的蛋白。信號識別體與內質網上的停泊蛋白結合,將核糖體送入多肽移位裝置,信號識別體被釋放,肽鏈繼續延伸。合成的肽鏈進入內質網小腔。
二、在內質網的修飾
多肽在內質網的修飾包括信號肽的切除、二硫鍵的形成、高級結構的折疊及核心糖化。在內質網中以長萜醇磷酸酯為載體合成核心糖鏈,然后轉移到蛋白質的天冬酰胺或絲氨酸、蘇氨酸上。
三、高爾基體的作用
高爾基體可對核心糖鏈進行修飾和調整,稱為末端糖化。多肽在此根據各自的結構進行分類,被運往溶酶體、分泌粒和質膜等目的地。
四、線粒體和葉綠體蛋白的合成
他們可編碼全部RNA,但所需的蛋白多數由核基因組編碼,在游離核糖體中合成。這些蛋白含有線粒體定向肽或葉綠體轉移肽,起信號肽的作用。
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