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對于其他疾病引起的繼發性腎小管性酸中毒首先應治療原發性疾病。如果原發性疾病可得到治愈，腎小管性酸中毒也可隨之治愈。對原發性疾病不能根治者，則只能和遺傳性腎小管性酸中毒一樣采取下列對癥治療。

腎小管性酸中毒的治療方法一般從以下幾個方面來考慮：

1.Ⅰ型腎小管性酸中毒的治療

首先，補充堿劑以糾正酸中毒。與近端腎小管性酸中毒不同，補堿量較少，但仍然需要補充足夠的堿以平衡酸的產生，常用枸櫞酸鉀，也可以用碳酸氫鈉，但是鈉鹽有可能加劇低鉀血癥。補充鉀鹽以糾正低鉀血癥。如氯化鉀片劑、氯化鉀緩釋膠囊、枸櫞酸鉀等。再次，防治腎結石、腎鈣化和骨病。

2.Ⅱ型腎小管性酸中毒的治療

能進行病因治療者，首先對因治療。患者丟失較多的碳酸氫根，因此需要補充的堿量也比較大（約24小時10～20mmol/Kg）。目前推薦使用枸櫞酸鈉、枸櫞酸鉀混合物，因為枸櫞酸代謝可以產生碳酸氫根，需要注意每日劑量應分多次服用，盡可能保持日夜復合平衡。但是補堿治療的藥物劑量大且口感差，因此患者長期依從性差。合用噻嗪類利尿劑可以減少堿的用量，但缺點是可能使低鉀血癥加劇。

由于在近端小管中碳酸氫根的重吸收是通過NBC與鈉離子的重吸收相藕聯，因此患者尚需限鹽飲食，以減少細胞外容積，促進腎小管對碳酸氫根的重吸收。為控制骨病，部分患者尤其是兒童患者，可予活性維生素制劑。

3.Ⅳ型腎小管性酸中毒的治療

治療方法和預后取決于潛在的病因，應了解患者的病史，特別是藥物史。除此之外，控制血鉀至關重要，避免任何潴鉀的藥物和高鉀飲食。補充鹽皮質激素，不僅可糾正高氯性代謝性酸中毒，而且可以糾正高鉀血癥。常用藥物為氟氫可的松。呋塞米可增加尿鈉Na，Cl-，K和H排泄，故也可用以治療Ⅳ型腎小管性酸中毒病人。與氟氫可的松聯合應用可增強療效。

4.混合性腎小管酸中毒Ⅲ型的治療

同近端及遠端腎小管酸中毒的治療。

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