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　　流腦是腦膜炎雙球菌引起的，是由帶菌者或病人經呼吸道飛沫傳染。乙腦是由乙腦病毒引起的，此種病毒通過蚊蟲先在牲畜(如幼豬、馬、牛等)中傳播，而后再傳播給人。

　　流腦流行每于冬末開始，春季盛行，到初夏就明顯下降，季節性不如乙腦嚴格。乙腦流行有嚴格的季節性，大都在夏季和初秋。兩種病發病開始都有發熱、頭疼、惡心嘔吐，典型病人可以有嗜睡、抽搐、昏迷等。但乙腦病人沒有菌血癥期，不會出現皮膚淤點，也少有很快出現休克者。雖然二者重癥的病人都會發生顱內壓增高的種種危險癥狀，但乙腦進展不象流腦那么迅速。流腦一般病程為7-10天左右，恢復期常在口、鼻周圍起皰疹，而乙腦病程約經2周方進入恢復期，甚至在發病6個月后仍遺留神經、精神方面的癥狀。其次兩者的腦脊液化驗結果也有很多不同。

　　流腦在腦脊液涂片或培養時可發現腦膜炎雙球菌，腦脊液渾濁如米湯樣，白細胞數和蛋白質明顯增高，而糖和氯化物減少;乙腦的腦脊液呈澄清或微混，白細胞數和蛋白質僅輕度增高，糖和氯化物一般正常。最后，流腦可用抗生素(如青霉素)控制感染，而乙腦因是病毒感染，至今尚無特殊治療法。流行性乙型腦炎：夏秋季流行，發病多集中于7、8、9月，與流腦不同。無皮疹。腦脊液外觀清，白細胞多在50-500×106/L，很少超過1000×106/L.初期(2-5天)中性多核細胞占多數，以后淋巴細胞占多數;糖及氯化物正常或稍增加。

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