SLE臨床表現多種多樣，常呈多器官受累，常因早期表現不典型，容易誤診和漏診。
（一）全身癥狀：發熱、乏力、體重減輕等。
（二）皮膚與黏膜：80％有皮膚損害，典型為面部蝶形紅斑；手掌大小魚際、指端和指（趾）甲周可出現紅斑；可有光過敏、脫發、雷諾現象；活動期有口腔潰瘍。
（三）關節與肌肉：85％關節受累，常表現不對稱的多關節痛，呈間歇性、紅腫少見，X線片多數正常。40％有肌痛，少數出現肌炎。
（四）腎：幾乎所有病人腎臟均有病理變化。臨床有表現的約75％，可表現為急性腎炎、急進性腎炎、隱匿性腎小球腎炎、慢性腎炎和腎病綜合征。早期可僅有尿檢異常，而晚期發生尿毒癥，是SLE死亡的常見原因。
（五）心血管系統：約30％有心血管表現，以心包炎最常見，約10％有心肌炎及周圍血管病。
（六）肺：約35％有狼瘡肺炎，偶有肺間質病變。
（七）神經系統：中樞神經系統以腦受累最常見，約10％有各種精神障礙，約l5％出現癲癇發作。中樞神經系統癥狀表示病情活動及危重，預后不良。少數發生偏癱、蛛網膜下腔出血、脊髓炎、顱神經及周圍神經病變。
（八）消化系統：約30％有消化系統癥狀，肝可以腫大，血清轉氨酶升高。少數發生急腹癥，表明SLE發作。
（九）血液系統：約30％有貧血，僅l0％為溶血性貧血，約40％有白細胞減少或淋巴細胞絕對數減少，約20％有血小板減少，可伴出血。部分可發生淋巴結和脾臟腫大。
（十）眼：約30％有眼底血管病變而影響視力，嚴重的可能致盲，及時治療可逆轉。繼發干燥綜合征時可有干燥性角結膜炎。