科學家繪出人類外顯子區域精細遺傳圖譜
更新時間:2010-10-13 14:00:49
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深圳華大基因研究院宣布,該院與美國加州大學伯克利分校、丹麥哥本哈根大學等單位合作,通過對200人的蛋白質編碼基因的外顯子區域進行深度測序,發現了大量以往未知的單核苷酸多態性位點,其中大部分在人群中都以較低頻率出現。該研究不僅完成了目前在人類外顯子區域規模最大、分辨率最精細的遺傳圖譜,同時表明這些遺傳變異可能導致復雜疾病的產生。該研究在《自然·遺傳學》上發表。
復雜疾病是在多因素共同作用下發生的,如多個基因、一個基因的多個突變、環境作用以及未知的隨機因素,遺傳模式比較復雜。對于復雜疾病來說,每個基因影響有限,單獨不足以致病。復雜疾病在普通人群中發病率較高,如精神分裂癥、糖尿病、癌癥等。本次研究人員對200名丹麥人的外顯子區域18654個編碼基因進行了捕獲測序,共發現了121870個單核苷酸多態性位點。研究人員證實,影響人類健康和疾病易感性的多態性位點往往出現頻率低,但是相關位點的個數很多。以往的研究通常對常見多態性位點進行測定,而對這些出現頻率低的多態性位點研究不夠,從而漏掉大量疾病關聯位點,造成“遺傳度缺失”。
該研究是中丹合作糖尿病關聯基因及變異研究(LUCAMP)項目的一部分。研究成果有助于構建人類基因組變異的完整圖譜,并且也可用于解釋人類基因組的遺傳漂移、突變、重組和選擇等。
據介紹,外顯子是真核生物基因的一部分,又稱表達序列。之前,深圳華大基因研究院采用外顯子組測序技術對50名藏族人的外顯子進行測序研究,并尋找到與藏族人高原適應性密切相關的候選基因。
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